Tijdens zijn hoogst geheime overheidsonderzoek naar tijdreizen verdwijnt de vader van Meg plotseling zonder enig spoor en laat zijn vrouw en kinderen alleen achter. Samen met haar broertje Charles Wallace en hun nieuwe vriend Calvin reist ze door tijd en ruimte naar een verre planeet om hem te zoeken. Onderweg krijgt het drietal te maken met de Machten van de Duisternis en Licht en ontmoeten ze...